במגמת מאמני כושר ילמדו התלמידים פרקים בתולדות החינוך הגופני והספורט, אנטומיה ופיזיולוגיה, הקשר בין פעילות גופנית ובריאות: תזונה, פציעות בספורט, מחלות ומניעתן, עישון ואלכוהול), תורת הכושר הגופני וכן גישות, שיטות ואמצעים לשיפור הכושר הגופני, היבטים פסיכולוגיים וחברתיים בחינוך הגופני.
תלמידים שילמדו במגמה זו יזכו לפתח ולטפח דפוסי פעילות והתנהגות גופנית וספורטיבית במסגרת עבודת צוות בגבולות הפוטנציאל האישי, להבטחת איכות חייו בריאותו ואישיותו. במהלך הלימודים ישתתפו התלמידים בימי כיף וגיבוש ייחודיים, ימי בריאות, נבחרות הספורט של בית הספר, הרצאות מקצועיות, ביקור במכללת וינגייט ובמעבדת ספורט ויארגנו פעילויות ספורט בבית הספר ובמרחב הקהילתי.
הלימודים במגמה כוללים לימודים עיוניים ומעשיים בהיקף של 5 יח"ל. ההתמחות במאמני כושר היא ייחודית לתיכון שז"ר. בוגרי המסלול זוכים לתעודת מדריך מוסמך במרחב הציבורי מטעם וינגייט שתאפשר להם לאמן בסיום התיכון.
